Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK-11Q9UQG0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-11Q9UQG0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms