Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms