Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHIC2Q9UKJ5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms