Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms