Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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