Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIMS3Q9UJD0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms