Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms