Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RNF7Q9UBF6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RNF7Q9UBF6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RNF7Q9UBF6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RNF7Q9UBF6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RNF7Q9UBF6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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