Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ2Q9P299 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms