Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms