Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms