Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms