Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms