Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOR4AQ9NXH8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms