Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCIQ9NVI1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms