Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMBRD1Q9NUN5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms