Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms