Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms