Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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