Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms