Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms