Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms