Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR6Q9HBX8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms