Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms