Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD3Q9H7E2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms