Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC90BQ9GZT6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms