Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms