Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms