Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms