Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms