Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM4Q9C037 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms