Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM6SF1Q9BZW5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM6SF1Q9BZW5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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