Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EDEM3Q9BZQ6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms