Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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