Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms