Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms