Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP3Q9BWW4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms