Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms