Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RSG1Q9BU20 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms