Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms