Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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