Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms