Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOPXQ9BPY8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms