Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms