Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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C9orf85Q96MD7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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C9orf85Q96MD7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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C9orf85Q96MD7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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C9orf85Q96MD7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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