Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL15Q96M94 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms