Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP53Q96M91 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms