Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC7Q96M83 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms