Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms