Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRIQ1Q96JM4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ1Q96JM4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms